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 La Historia dice que, en un principio, el nombre del pueblo era Fuente del Moral, y que este tenía agregado otro núcleo urbano llamado Zarzal. Se supone que, con el paso del tiempo, al unirse los dos núcleos, ambos nombres se fusionaron y, por evolución formaron el actual.
Tras la reconquista, la zona quedó despoblada por la marcha forzosa  de los árabes. Y parece que fueron los ganaderos segovianos lo que repoblaron el lugar. Este hecho fue uno de los que marcaron su dominio y jurisdicción sobre esta zona. Más tarde, el municipio llegó a formar parte del Real de Manzanares. En Junio de 1636, seseparó del Real de Manzanares y se hizo Villa independiente. En este año aparece ya como Moralzarzal. En este entorno, tiene a su disposición una residencia para la tercera edad muy cerca de Aranjuez.
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